從前有位“光之巨人”，他負責保衛世界和平，對抗巨型怪物和外星人入侵的威脅。他就是機動奧特曼。他曾在執行任務時與科學考察隊員早田進建立起聯繫，並在使命完成後離開了地球。時至今日，人類已進入了繁榮時代，但這只不過是和平的假象...現在，世界再次需要“光之巨人”的力量。就在這時，一個新的英雄出現了，他繼承了光的基因。但是他並不高大，是一名中等身材、多愁善感的高中生，穿著金屬動力制服。他的名字叫早田進次郎，是初代機動奧特曼早田進的兒子。早田進次郎克服種種困難成為新一代機動奧特曼，一個新的故事就此展開。