友引高中即將迎來新一年的學園祭，上到老師，下到學生，卻都為了這個重要節日而忙碌。雖然應名還有最後一天的準備時間，但是日復一日，年復一年，學園祭開幕式卻遲遲未能舉行。疲勞的溫泉老師從中感到蹊蹺，他感到自己與周圍的人每年都過著同樣的生活，卻絲毫未能察覺奇怪之處。溫泉將這個想法告訴了櫻花老師，兩人商議命令天天泡在學校的學生們回家，可是無論如何兜兜轉轉，面堂等人最終還是回到了學校門口，而留守的溫泉老師也就此失蹤。經過數日同樣的詭異生活，面堂、阿當等人同意與櫻花老師成立事件真相糾察小組，大家一同進入了時間和空間分外詭異的友引高中……
　　本片根據漫畫家高橋留美子的原作改編，是該系列動畫的第二部電影版，導演押井守對影片的全新詮釋卻引起了原作者的不滿。